Comment utiliser Anagène pour traiter des séquences ?

Pour traiter des séquences d'acides nucléiques ou de protéines

Utilisation d'Anagène

d'après Outils pour les activités pratiques en SVT

Les icônes de la barre d’outils

Les bulles d’aide

Pour vous aider, une bulle d’aide s’affiche sur l’objet pointé par le curseur de la souris

 

Editer une séquence

Sélectionner une séquence

Sélectionner cette séquence dans l’un des répertoires d’Anagène :

  • Banque de séquences
  • Thèmes d’étude
  • Programmes et documents

ou par Fichier/ Ouvrir

 

Le bouton de sélection affiche une flèche rouge.

Cliquer sur le bouton de sélection. La séquence sélectionnée s’inscrit sur fond blanc. Elle est qualifiée de ligne pointée.

 

Traiter une séquence

Comparer des séquences

Utiliser pour cela le menu traiter. On peut comparer les séquences ou convertir ces séquences. Pour traiter une séquence, elle doit être au préalable sélectionnée.

 

La comparaison des séquences ne peut se faire que sur des séquences de même nature. La séquence référence sera toujours placée en premier. Les flèches haut-bas situées à
gauche du tableau permettent de déplacer la séquence sélectionnée.
On peut utiliser dans ce cas, la comparaison simple ou la comparaison par alignements avec discontinuités.

La comparaison simple est utilisée pour comparer deux allèles d’un même gène ou des séquences homologues.

Informations sur la séquence sélectionnée

Utiliser le menu informations / informations sur la ligne pointée pour obtenir des informations sur la séquence sélectionnée par rapport à la séquence choisie comme référence.

ATTENTION : la séquence de référence est toujours placée en premier.

Les flèches permettent de déplacer la séquence sélectionnée (vers le haut, vers le bas).